借り換えにより不動産担保ローンを利用する場合は既存の借入先抵当権等の抹消登記費用が発生します。
この抹消登記は、不動産担保ローンを実行する際に同時に行います。
（根）抵当権の抹消登記費用としては
①税金部分（主に登録免許税）と②報酬部分（司法書士）に大きく分かれています。
①実費
・登録免許税・・・不動産の筆数×１，０００円
②報酬
・抹消登記・・・概ね数千円～数万円かかります。
一度設定された抵当権の抹消登記の登録免許税は１筆１，０００円でが、筆数が多いと金額もかさみます。
事前調査費用 （登記事項証明書などの取得費用など）や事後謄本の取得費用などは、借換えにより新たに設定する抵当権の登記費用に含まれてくることが多いと思います。